Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN3Q969G5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms