Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms