Protein–RNA interactions for Protein: Q92841

DDX17, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX17Q92841 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX17Q92841 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms