Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms