Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms