Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms