Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113Q902F9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113Q902F9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms