Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms