Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BEST4Q8NFU0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms