Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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