Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms