Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTD1Q8N815 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTD1Q8N815 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTD1Q8N815 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTD1Q8N815 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTD1Q8N815 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms