Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms