Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUDCD3Q8IVD9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUDCD3Q8IVD9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms