Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms