Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC51AQ86UW1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC51AQ86UW1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC51AQ86UW1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC51AQ86UW1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC51AQ86UW1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms