Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms