Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms