Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC29A4Q7RTT9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms