Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms