Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms