Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD1Q6UXZ0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms