Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms