Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA5Q6Q788 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA5Q6Q788 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA5Q6Q788 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA5Q6Q788 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA5Q6Q788 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA5Q6Q788 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA5Q6Q788 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA5Q6Q788 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms