Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms