Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms