Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNS3Q68CZ2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNS3Q68CZ2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNS3Q68CZ2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNS3Q68CZ2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNS3Q68CZ2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNS3Q68CZ2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNS3Q68CZ2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNS3Q68CZ2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNS3Q68CZ2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNS3Q68CZ2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNS3Q68CZ2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNS3Q68CZ2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms