Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms