Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWC8

HACD4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD4Q5VWC8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD4Q5VWC8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms