Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms