Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms