Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms