Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms