Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms