Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms