Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms