Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms