Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms