Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms