Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms