Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KIAA1644Q3SXP7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms