Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PROX2Q3B8N5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms