Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EDRF1Q3B7T1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EDRF1Q3B7T1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms