Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms