Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms