Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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