Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRY1Q16526 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms