Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
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