Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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SCN9AQ15858 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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SCN9AQ15858 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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SCN9AQ15858 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN9AQ15858 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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