Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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